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Welches Format soll denn die Datenbank zukünftig haben, muss es wieder Access sein? (Das ist sehr alt und nicht zu empfehlen).

Ich kenne leider keine wirklich simple Software für so etwas, das könnte man scripten allerdings geht das über reines SQL deutlich hinaus. Je nach eingesetzter Datenbank und Lizenz gibt es auch Importassistenten die man passend konfigurieren kann.